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SNP解析の将来は?

1 :228:2006/05/01(月) 22:17:42
私は現在、SNP(一塩基多型)の解析研究にいそしんでいます。
SNPもそろそろネタがつきてきたように思っているのですが、SNP
解析をさらに発展させるような新しい研究手法がありましたら、
ご教示願いたい。

2 :名無しゲノムのクローンさん:2006/05/01(月) 22:28:52
>1
現在、どの様な手法を使われていますか?

3 :名無しゲノムのクローンさん:2006/05/01(月) 22:41:42
葉を見て森を見ず状態になってきているのは急ぎすぎたからか

4 :228:2006/05/01(月) 22:51:57
疾患原因候補遺伝子のSNPをタイピングして、ハプロタイプ解析して、
臨床データとの相関を見ようとしています。ただ、糖尿病などの多因子性
疾患の場合は、あて実験になるような感じがします。
Affymetrixの500K tipなどを使えば、whole genome SNPs解析ができるんですが、
結果の解釈が難航しそうなので、手をつけていません。

5 :228:2006/05/01(月) 23:06:57
疾患や薬物動態は遺伝因子だけではなく、環境要因も複雑に関わって
くるはずです。ただ、環境要因は不確定要素が多すぎ、アナログ的です。
SNPはデジタルだから解析しやすいが、それだけでは説明できないという
限界に近づいている今日この頃です。

6 :名無しゲノムのクローンさん:2006/05/01(月) 23:17:14
そりゃそうだ
統計学的な解釈がまだ発展の余地があるらしいけど

7 :228:2006/05/01(月) 23:31:55
Microsatelliteやcopy number variantsによる羅患率の変化の解析
なんかはポストSNPの候補になりそうですが?

8 :228:2006/05/02(火) 00:10:37
ちなみにユースケのところの人間ではありません。

9 :名無しゲノムのクローンさん:2006/05/02(火) 00:14:28
オ○コセラピー?

10 :名無しゲノムのクローンさん:2006/05/05(金) 18:16:39
>>228
じゃあ、止めた方がよくない?
力仕事だし、ゆーちゃんの1人がちじゃん。

11 :228:2006/05/07(日) 06:18:13
>>10
そうなんだけど、ユースケもワンパターンでそろそろ打ち止め(年齢的にも)
のような気がするんだよ。だから、このスレでSNP解析の将来性や可能性に
ついて語っていこうではないかと、、、

12 :名無しゲノムのクローンさん:2006/05/07(日) 10:46:12
うーすけの弟子ってだれがいるの?

13 :名無しのゲノムのクローンさん:2006/05/30(火) 23:01:53
ユースケのところも終わりだろ
期待してた助教授も出ていっちゃったし、恩顧も株価下がってるし

14 :名無しゲノムのクローンさん:2006/05/30(火) 23:49:39
怒るとサメみたいな眼になりますよね、あの人。

15 :名無しゲノムのクローンさん:2006/05/31(水) 00:17:23
ユースケラボは北朝鮮みたいらしい

16 :名無しゲノムのクローンさん:2006/05/31(水) 00:20:32
喜び組?

17 :名無しゲノムのクローンさん:2006/05/31(水) 00:55:49
>>13
期待してた助教授って誰?

18 :名無しのゲノムのクローンさん:2006/05/31(水) 01:04:40
ところで、当代の研究所助教授のパワハラって誰のこと?

19 :名無しゲノムのクローンさん:2006/05/31(水) 01:32:31
パワハラで東大助教授停職 助手から現金127万円
 東大の研究所に所属する40代の男性助教授が「試薬の購入代金が高すぎる」と部下の助手を責め、助手から現金約127万円を受け取るなど悪質なパワーハラスメントを続けていたとして、東大は30日、助教授を停職2カ月の懲戒処分にした。
 助教授は助手に対し、研究所への出入りを約4カ月間禁じ、給与相当分などとして約380万円の支払いを請求したが、助手は応じなかった。
 東大によると、助教授は2003年、試薬の購入価格が相場より高いとして、購入担当だった助手の職務怠慢を指摘。自分が適正と考える金額との差額を助手に示した。受け取った金は研究室で管理し、私的な流用は確認できなかった。
(共同通信) - 5月30日16時59分更新

20 :名無しのゲノムのクローンさん:2006/06/01(木) 00:41:02
具体的には?
やっぱりH腰?

21 :名無しゲノムのクローンさん:2006/06/01(木) 00:54:09
イルミナどうよ?

22 :名無しゲノムのクローンさん:2006/06/03(土) 00:09:39
>>13>>17もしかしてイッツロー先生のこと?


23 :名無しゲノムのクローンさん:2006/06/03(土) 00:10:36
ちなみにサンタマはまだ若いぞ?
50台ぎりぎりじゃなかったか?
あと15年は君臨

24 :名無しゲノムのクローンさん:2006/06/06(火) 22:54:01
ガイアの夜明けにサンタマリア先生が出てた!

25 :名無しゲノムのクローンさん:2006/06/08(木) 00:54:36
サンタマちょっとつむじの辺りがはげてた

26 :名無しゲノムのクローンさん:2006/07/02(日) 00:02:57
灯台先端研のLSBMがやっている業績などどうよ?

27 :名無しゲノムのクローンさん:2006/07/02(日) 00:41:26
>>23
もう半ば近い。

>>25
それくらい許してやれ。

>>26
先端券に居るということがどういう意味か考えてから質問しろ。

28 :名無しゲノムのクローンさん:2006/07/03(月) 21:35:22
>>26
先端研ならヤッツケ仕事みたいな論文業績でしょ?
少し時間が経てばボロがでるか、新しい方法論に
よって存在が薄れるかのどちらかじゃないの?

長期的にみれば、腰をすえてやっている所の方が
いろんな面で良かったり

29 :28:2006/07/03(月) 21:41:52
ところで、先端研ってSNP解析なんてやってましたか?w
まあいろんなものに手を出してるんでしょうけど・・・

もしかしてLSBMの所のこと?

30 :名無しゲノムのクローンさん:2006/11/28(火) 01:05:13
>>29

http://www.lsbm.org/news/2006/1123.html

日本の報道と海外の報道の差を比較すると面白い。

31 :名無しゲノムのクローンさん:2006/11/28(火) 20:03:14
なんでこんなに差があるの?

これは一種のプロジェクトでしょ・・
結局、この成果を導くために主導的な役割を果たしたところはどこなの?

32 :名無しゲノムのクローンさん:2006/11/28(火) 20:43:03
こんな優秀な結果を出したのであれば、未来創薬研究所も有名になるじゃん。

33 :名無しゲノムのクローンさん:2006/11/29(水) 20:50:31
Nature誌に載ったといっている割にいまいち盛り上がらないのはなぜ?

34 :名無しゲノムのクローンさん:2006/11/30(木) 09:41:51
SNPに明日はない。タコ研のYNこのプロジェクトやめちゃってるジャン

35 :名無しゲノムのクローンさん:2006/11/30(木) 19:57:28
>>タコ研のYNこのプロジェクトやめちゃってるジャン

なんでやめたの?
面白くないことでもあったのか?

36 :名無しゲノムのクローンさん:2006/12/01(金) 20:59:07
>>30
これって凄いことなの?

37 :名無しゲノムのクローンさん:2006/12/02(土) 10:11:04
>>36
やったってだけ。そのうち海外にすてられるんじゃん?

38 :名無しゲノムのクローンさん:2006/12/02(土) 19:46:18
なんだか哀しいなあ

39 :名無しゲノムのクローンさん:2006/12/03(日) 16:04:17
YNさんSNPをやっていたこともあったなあ・・
もう止めちゃったの?
本来シークエンスでしょ・・

40 :名無しゲノムのクローンさん:2006/12/05(火) 22:07:31
>>30

こんなことくらいで喜んでいていいのか?

41 :名無しゲノムのクローンさん:2006/12/06(水) 07:17:08
>>40

海外のプラットフォームがメインで、日本のチームは便乗しただけ。

42 :名無しゲノムのクローンさん:2006/12/06(水) 20:29:39
なんであんなに日本のメディアは騒いでいたのかなあ?
ネタがなかったからか、それとも情報を売り込んだのか?

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